Do kompetencji Naczelnika należą w szczególności:
- przedkładanie Dyrektorowi Izby Skarbowej wniosku o zatwierdzenie i nadanie regulaminu organizacyjnego Urzędu Skarbowego a także o zmianę regulaminu organizacyjnego,
- wnioskowanie do Dyrektora Izby Skarbowej o powołanie oraz odwołanie Zastępcy Naczelnika,
- przedstawianie stanowiska w sprawach organizacyjno-finansowych z zakresu prawa pracy wskazanych w ustawie o urzędach i izbach skarbowych,
- wykonywanie zadań wskazanych w upoważnieniu Dyrektora Izby Skarbowej ,
- składanie sprawozdań i informacji przedkładanych centralnym organom administracji państwowej, jednostkom samorządu terytorialnego, Rzecznikowi Praw Obywatelskich, posłom, senatorom, sądom, prokuraturze,
- przekazywanie skarg na działanie Urzędu do Izby Skarbowej,
- podejmowanie decyzji w sprawie wyłączenia pracowników od załatwiania spraw,
- udzielanie odpowiedzi na wystąpienia i zarządzenia pokontrolne wydane w następstwie kontroli przeprowadzonych w Urzędzie,
- podpisywanie imiennych upoważnień do kontroli podatkowej,
- wydawania rozstrzygnięć w trakcie postępowania przygotowawczego w zakresie prowadzonych postępowań karnych skarbowych w tym kończących te postępowania,
- występowania do banków i innych instytucji finansowo-kredytowych o udzielanie informacji objętych tajemnicą bankową,
- podpisywanie korespondencji do Ministerstwa Finansów i innych urzędów centralnych, izb skarbowych, izb celnych, urzędów kontroli skarbowej, sądów, prokuratur oraz organów bezpieczeństwa państwa,
- podejmowanie decyzji i składanie oświadczeń woli wynikające z art. 58 ustawy o finansach publicznych w sprawach umorzeń, odroczeń oraz rat wyłączonych z regulacji Ordynacji Podatkowej,
- podejmowanie rozstrzygnięć, podpisywania pism i zajmowani a stanowiska we wszystkich sprawach z zakresu bezpośrednio nadzorowanych komórek organizacyjnych, za wyjątkiem przekazanych do ostatecznej aprobaty Zastępcom bądź kierownikom komórek organizacyjnych,
- zatwierdzanie planów planów kontroli u podatników i płatników,
- w zakresie spraw podatkowych:
a) wydawanie decyzji i postanowień wydanych w wyniku uwzględnienia w całości wniesionych środków odwoławczych,
b) zatwierdzanie poleceń odpisu przedawnionych zaległości podatkowych,
c) podpisywanie decyzji administracyjnych w zakresie podatku dochodowego powyżej kwot określonych w imiennych upoważnieniach, - podpisywanie decyzji administracyjnych w zakresie podatków majątkowych powyżej kwot określonych w imiennych upoważnieniach,
- podpisywanie decyzji administracyjnych w zakresie podatku VAT powyżej kwot określonych w imiennych upoważnieniach,
- podpisywanie decyzji w sprawie ulg uznaniowych powyżej kwot określonych w imiennych upoważnieniach,
- podpisywanie decyzji orzekających o zwrocie kwoty zwrotu części wydatków poniesionych na zakup materiałów budowlanych powyżej kwot określonych w imiennych upoważnieniach,
- akceptacja zwrotów podatku od towarów i usług powyżej kwot określonych w imiennych upoważnieniach,
- akceptacja nadpłat w podatkach dochodowych powyżej kwot określonych w imiennych upoważnieniach,
- podpisywanie decyzji stwierdzających nadpłatę powyżej kwot określonych w imiennych upoważnieniach,
- podpisywanie decyzji orzekających o zabezpieczeniu powyżej kwot określonych w imiennych upoważnieniach,
- podpisywanie postanowień w zakresie przedłużenia terminu zwrotu nadwyżki podatku naliczonego nad należnym,
- akceptacja zwrotów nadpłaty na skorygowanych deklaracjach powyżej kwot określonych w imiennych upoważnieniach,
- podpisywanie postanowień o umorzeniu postępowań egzekucyjnych zaległości podatkowych powyżej kwot określonych w imiennych upoważnieniach.