Do ostatecznej aprobaty Naczelnika Urzędu zastrzeżone są:
- opracowywanie projektu regulaminu oraz wydawanie, zmiana i uchylanie dokumentów o charakterze organizacyjnym, w szczególności wewnętrznych procedur postępowania, wydawanych przez naczelnika urzędu skarbowego w zakresie realizacji zadań określonych w art. 5 ust. 6 i ust. 6a ustawy o urzędach i izbach skarbowych oraz w innych przepisach odrębnych,
- zajmowanie stanowiska w sprawach dotyczących stosunku pracy pracowników, tj. zmiany warunków pracy i płacy, rozwiązania stosunku pracy, przeniesienia służbowego, na zasadach określonych w ustawie o urzędach i izbach skarbowych,
- udzielanie pisemnych upoważnień poszczególnym pracownikom do załatwiania spraw w imieniu Naczelnika Urzędu, w tym także do wydawania decyzji i postanowień,
- składanie sprawozdań i informacji przedkładanych: centralnym organom administracji państwowej, jednostkom samorządu terytorialnego, Rzecznikowi Praw Obywatelskich, posłom, senatorom, sądom, prokuraturze, oraz udzielanie informacji dla prasy, radia i mediów elektronicznych,
- przekazywanie skarg na działanie Urzędu Skarbowego do Izby Skarbowej,
- podejmowanie decyzji w sprawie wyłączenia pracowników od załatwiania spraw,
- podpisywanie korespondencji do Ministerstwa Finansów, innych urzędów centralnych, izb skarbowych, izb celnych, urzędów kontroli skarbowej, sądów i prokuratur oraz organów bezpieczeństwa państwa, z wyjątkiem spraw przekazanych upoważnionym pracownikom,
- udzielanie odpowiedzi na wystąpienia i zarządzenia pokontrolne wydane w następstwie kontroli przeprowadzanych w Urzędzie Skarbowym,
- podpisywanie imiennych upoważnień do kontroli podatkowej,
- podpisywanie decyzji i postanowień w sprawach:
- ustalenia wysokości zobowiązania podatkowego z tytułu nieujawnionych źródeł przychodu,
- przedłużenia terminu zwrotu podatku;
- wydawanie poleceń wyjazdów służbowych,
- występowania do banków i innych instytucji finansowo - kredytowych o udzielenie informacji objętych tajemnicą bankową, w szczególności o stanie konta podatnika i dokonywanych operacjach,
- udzielanie pełnomocnictw dla radcy prawnego i pracowników do reprezentowania Naczelnika Urzędu lub Urzędu Skarbowego przed sądami powszechnymi, sądami administracyjnymi i innymi organami orzekającymi,
- podejmowanie innych rozstrzygnięć, podpisywanie pism i zajmowanie stanowiska w innych sprawach z zakresu bezpośrednio nadzorowanych komórek organizacyjnych, za wyjątkiem przekazanych do ostatecznej aprobaty upoważnionym pracownikom.