Pierwszy Zastępca Naczelnika upoważniony jest do podejmowania rozstrzygnięć, podpisywania pism i zajmowania stanowiska we wszystkich sprawach z zakresu bezpośrednio nadzorowanych komórek organizacyjnych, niezastrzeżonych w niniejszym regulaminie lub w odrębnych przepisach do ostatecznej aprobaty Naczelnika Urzędu.
Pierwszy Zastępca Naczelnika sprawuje bezpośredni nadzór nad następującymi komórkami organizacyjnymi:
Pion kontroli (SZNK), w skład którego wchodzą:
a) Dział Czynności Analitycznych i Sprawdzających (SKA),
b) Dział Kontroli Podatkowej (SKP),
c) Referat Identyfikacji i Rejestracji Podatkowej (SKI),
d) Wieloosobowe Stanowisko Spraw Karnych Skarbowych (SKK)